From fluorescence microscopy to analysis challenges of large 3D objects

Journée scientifique du LYMIC (Lyon Multiscale Imaging Center)
13 octobre 2021 - Lyon, Faculté Rockefeller

Nous avons le plaisir de vous convier à la 4ème journée de Lyon Multiscale Imaging Center le 13 octobre 2021, à la Faculté Rockefeller de Lyon 8ème. Cette journée a pour thème l’imagerie en 3D des échantillons volumineux, de la microscopie à fluorescence au défi de l’analyse.
Dans le contexte de crise sanitaire actuel nous avons ouvert 50% de places disponibles. Cette jauge est susceptible d’évoluer en fonction des directives de l’UCBL. Les personnes n’ayant pas de place en présentiel seront mises sur liste d’attente. Nous les contacterons par ordre d’inscription si la jauge augmente.
La journée sera retransmise en direct sur Webex. Un courriel sera envoyé aux inscrits la veille et un contrôle d’accès nominatif sera effectué. L’enregistrement des conférences sera ensuite disponible en ligne.
Très important : Le nombre de places sur site étant limité, nous vous demandons en cas d’indisponibilité d’annuler au plus tôt, nous contactant à ciqle@univ-lyon1.fr.
Bien entendu nous devrons veiller au respect des gestes barrières dont le port du masque dans l’enceinte de la faculté. Le passe sanitaire sera obligatoire pour assister à la journée en présentiel (avec vérification de votre QRcode).
Au plaisir de vous voir le 13 octobre,
Le comité d’organisation.
Lieu : Faculté Rockefeller, 8 Av. Rockefeller, 69008 Lyon Plan d'accès
Program
9h00Clarification & microscopy: from basics to advanced methodsFrance Lam (UPMC Sorbonne, Paris)
9h45Adaptative confocal microscopy for imaging large objectAntoine Delon (LiPhy, Grenoble)
10h25Break
10h45Image size, good practices for sampling consideration, size reduction, image compressionLydia Danglot (Institut de Psychiatrie et de Neurosciences de Paris)
11h303D imaging after clearing: theory and applications to study postnatal developmentPaolo Giacobini (INSERM, Lille)
12h20Lunch
13h00Quantification of fluorescent signal in big 3D object: lessons from X-Rays analysisEmmanuel Brun (STROBE Team, Grenoble)
13h45Segmentation in low signal/noise images from cleared unlabeled heartMatthieu Chourout (CarMeN/CRNL, Lyon)
14h30Whole brain mapping of neuronal activity and axonal projections to study of parental behaviorsThomas Topilko (Institut du Cerveau et de la moelle épinière, Paris)
15h10Break
15h30Digital atlas and segmentation of myelin fibers from MRI imagesMarine Breuilly (Lymic, Lyon)
16h15Multimodal imaging for a comprehensive study of neuronal network - organizationJean-Christophe Deloulme (Institut des Neurosciences, Grenoble)
17h00Closure